Проверките за контрол по опазване и използване на водите и водните обекти касаят:

• Пречиствателни съоръжения за отпадъчни води;
• Канализационни системи;
• Състояние и правилна експлоатация на пречиствателни станции за отпадъчни води от населени места;
• Изпълнение на условия в издадените разрешителни за ползване на водни обекти с цел заустване на отпадъчни води и контрол на основните емитери, формиращи отпадъчни води и заустващи в повърхностни водоприемници;
• Провеждане на емисионен контрол на обекти, заустващи в повърхностни водни обекти в съответствие с издадени Разрешителни за заустване на отпадъчни води по чл. 46 от Закона за водите (обн. ДВ, бр. 67 /1999 г.) и Комплексни разрешителни по Закона за опазване на околната среда (обн. ДВ, бр. 91 /2002 г.), Заповед № РД - 279 /2006 г. на МОСВ и утвърден списък на емитерите;
• Състояние на хвостохранилища, шламохранилища, насипища и системите за следене на сигурността им.    

Участие в процедурите по издаване на разрешителни за ползване на воден обект за заустване на отпадъчни води:

• Изготвяне на становища по проекти на разрешителни за заустване на отпадъчни води във водни обекти;
• Окомплектоване и изпращане на документацията в съответната Басейнова Дирекция: БД–ЗБР, гр. Благоевград, БД-ДР, гр. Плевен и БД–ИБР, гр. Пловдив.

Изготвяне на становища в съответствие с нормативните изисквания на екологичното законодателство, с цел опазване и ползване на водите и водните обекти:

• Становища за преценяване необходимостта от извършване на ОВОС за инвестиционни предложения;
• Становища за екологичното състояние на обекти след приватизация;
• Становища за приоритетност относно предоставяне на средства от ПУДООС и екологичните фондове за водоснабдяване и изграждане на пречиствателни станции на отпадъчни води;
• Становища във връзка с проекти по програмата за отстравяване на щети от стари замърсявания.
• Становища за въвеждане на обекти в редовна експлоатация в съответствие с изискванията на Наредба № 2 /31.07.2003 г. за въвеждане в експлоатация на строежите в Република България и минималните гаранционни срокове за изпълнени строителни и монтажни работи, съоръжения и строителни обекти.

Участие в приемателни комисии, съгласно Наредбата за разрешаване ползването на строежите в Република България. Контрол по изграждането на екологични обекти.

• ВЕЕС в МОСВ;
• МЕЕС в МОСВ;
• ЕЕС в РИОСВ.

• Извършване на проверки и емисионен контрол на обекти - емитери на отпадъчни води и заустващи в повърхностни водни обекти по поречия Струма и Ерма. /съгласно Заповед № РД-484 /14.05.2004 г., изм. и доп. със З-д № РД-279 /09.05.2006 г. на Министъра на околната среда и водите/;
• Контрол по спазване разрешителния режим при ползване на водни обекти за заустване на отпадъчни води - извършване на проверки на обекти с издадени Разрешителни за заустване на отпадъчни води и Комплексни разрешителни, с цел контрол по изпълнение на условията и изискванията определени в тях;
• Контрол по работата на производствата, технологичните инсталации и пречиствателни съоръжения за отпадъчни води;
• Контрол върху операторите, стопанисващи и ползващи канализационни системи и пречиствателни съоръжения;
• Контрол състоянието на хвостохранилища, шламохранилища, насипища и системите за следене на сигурността им;
• Извършване на проверки и изготвяне на отговори във връзка с постъпили сигнали и жалби за замърсяване на води и водни обекти;
• Контрол при аварийни ситуации и залпови изпускания във водни обекти;
• Изготвяне на санкции при констатирани замърсявания и нарушения на нормативната уредба за опазване на водите - прилагане разпоредбите на чл. 69 от Закона за опазване на околната среда /обн. ДВ бр. 91 /2002 г./ и Наредбата за реда за определяне и налагане на санкции при увреждане или замърсяване на околната среда над допустимите норми /обн. ДВ бр.69 /2003 г./;
• Изготвяне на необходимата документация относно изплащане на разходите за лабораторен контрол на обекти – замърсители на водите и водните обекти;
• Съставяне на актове за установени административни нарушения по Закона за водите и Закона за опазване на околната среда.

• Проверка по изпълнението на дадени предписания;
• Проверка по изпълнението на решенията по ОВОС;
• Проверки във връзка с изпълнение на условията, определени в разрешителните за ползване на воден обект за заустване на отпадъчни води;
• Изготвяне на доклади и отчети за обекти подлежащи на задължителен контрол.